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        qPCR實(shí)驗(yàn)常見(jiàn)問(wèn)題及解決方法

         更新時(shí)間:2024-04-01 點(diǎn)擊量:1091
         PCR是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction)的簡(jiǎn)稱,是一種選擇性體外快速擴(kuò)增DNA片段的方法。在體外以類似于細(xì)胞內(nèi)DNA的半保留復(fù)制過(guò)程,以擬擴(kuò)增的模板DNA分子,與模板DNA互補(bǔ)的寡核苷酸引物、DNA聚合酶、4dNTP及適合的緩沖體系組成的反應(yīng)體系,經(jīng)過(guò)重復(fù)地變性一退火一延伸三步,擴(kuò)增新的目的DNA鏈,這個(gè)過(guò)程通過(guò)控制反應(yīng)體系的溫度來(lái)實(shí)現(xiàn)??梢栽诙虝r(shí)間內(nèi)將微量的DNA片段擴(kuò)增到足夠數(shù)量,用于后續(xù)的研究和檢測(cè)。下面讓我們一起來(lái)看看qPCR實(shí)驗(yàn)的常見(jiàn)問(wèn)題及解決方法吧!

        一、擴(kuò)增曲線不穩(wěn)定

        可能原因

        RNA純度低;體系中存在較多雜質(zhì);儀器使用時(shí)間過(guò)長(zhǎng)。

        解決方案

        1)提取高純度的RNA,小心操作。

        2)對(duì)儀器進(jìn)行校準(zhǔn)。

        二、擴(kuò)增無(wú)法達(dá)到平臺(tái)期

        可能原因

        模板濃度太低;循環(huán)數(shù)太少;試劑擴(kuò)增效率低。

        解決方案

        1) 提高模板量

        2) 提高循環(huán)數(shù)

        3) 用標(biāo)準(zhǔn)曲線測(cè)定擴(kuò)增效率,提高鎂離子濃度,換用擴(kuò)增效率高的試劑。

        三、熒光下降

        可能原因

        存在降解;模板濃度過(guò)高。

        解決方案

        1) 提高體系純度

        2) 降低模板量

        3) 降低熒光閾值

        四、單峰、峰不尖銳

        可能原因

        與試劑成分有關(guān);或存在大小相近的非特異性擴(kuò)增。

        解決方案

        1) 溫度跨度不高于7度,視為可用結(jié)果

        2) 進(jìn)行高濃度瓊脂糖電泳,確認(rèn)是否為單一條帶。

        五、單峰,Tm低于80

        可能原因

        只有引物二聚體,無(wú)目的條帶;或擴(kuò)增片段過(guò)短。

        解決方案

        1) 檢查是否加入模板

        2) 進(jìn)行瓊脂糖電泳檢測(cè),確定條帶大小是否正確

        六、雙峰,較低峰Tm80度之前

        可能原因

        由于模板濃度過(guò)低或引物濃度過(guò)高使多余引物形成引物二聚體。

        解決方案

        1) 適當(dāng)提高退火溫度

        2) 提高模板量,降低引物濃度

        3) 重新設(shè)計(jì)引物。

        七、qPCR注意事項(xiàng)

        ·提高樣品純度,盡量減少樣品之間的交叉污染。

        ·每個(gè)樣品至少要做3個(gè)平行孔,以防在 后面的數(shù)據(jù)分析中,由于Ct相差較多或者SD太大,無(wú)法進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。

        ·MasterMix不要反復(fù)凍融,如果經(jīng)常使用,最好融解后放 在4℃;配置體系時(shí)在冰上操作;減少加樣誤差,每管或每孔都要換新槍頭,不要連續(xù)用同一個(gè)槍頭加樣;所有成分加完后,離心去除氣泡。

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